Chromista

« Chromiste » redirige ici. Ne pas confondre avec Chromisme ni Chromite.

Chromista

Macrocystis pyrifera.

Classification Taxonomicon
Clade	Biota
Clade	Neomura
Domaine	Eukaryota
Clade	Neokaryotes
Clade	Neozoa
Super-règne	Corticata

Règne

Chromista
Cavalier-Smith, 1981

Sous-règnes de rang inférieur

Hacrobia Okamoto, Chantangsi, Horák, Leander & Keeling (2009)
Harosa Cavalier-Smith, 2010

Les Chromistes^[a] (Chromista) sont un règne d'organismes uni- et pluricellulaires eucaryotes regroupant des taxons historiquement considérés comme des protozoaires (Foraminifères, Radiolaires, Ciliés, etc.), comme des champignons (Oomycètes, Labyrinthulomycètes, etc.) et des algues (Algues brunes, Diatomées, etc.).

Historique

Ce règne a été proposé par le biologiste britannique Thomas Cavalier-Smith en 1981^[1]. Les Chromista étaient d'abord un clade supposé d'organismes eucaryotes pour la plupart photosynthétiques, regroupant également certains organismes autrefois classés parmi les « champignons inférieurs » — donc hétérotrophes. La pertinence de ce clade a été remise en cause par des études de 2007^[2] rapprochant les Stramenopiles des Rhizaria. Il a donc été proposé d'utiliser le terme de Chromista pour désigner l'ensemble présumé monophylétique formé par les Harosa et les Hacrobia à la place du terme de Chromalveolata au sens large^[3].

Les Chromistes sont moins diversifiés que les algues vertes mais plus que les algues rouges^[4].

Le groupe Chromista est polyphylétique, alors, ce nom n'est plus utilisé pour le groupe^[5]^,^[6]^,^[7].

Étymologie

Le terme Chromista dérive du grec χρῶμα / chróma, couleur, en référence aux pigments de ces organismes qui leur donne une teinte plus ou moins soutenue. Le terme fut inventé en 1981 par le biologiste britannique Thomas Cavalier-Smith, sur la base de termes plus anciens, par exemple Chromophyta.

Caractéristiques propres

On trouve des caractéristiques propres au groupe, qui peuvent avoir disparu secondairement :

Un réticulum périplastidial, situé entre les deux enveloppes du chloroplaste et les deux membranes externes.
Les deux sous-groupes Straménopiles et Haptophytes présentent les mêmes pigments photosynthétiques.
Le chloroplaste de la cellule est constitué de quatre membranes : les deux membranes communément trouvées chez les chloroplastes et deux membranes externes reliées le plus souvent à l'enveloppe nucléaire. Cette situation serait le résultat d'une endosymbiose secondaire et plus précisément d'une ingestion d'une Rhodophyte unicellulaire par un autre Eucaryote. À ce sujet, la communauté scientifique cherche à savoir si l'endosymbiose s'est effectuée plusieurs fois au sein des Chromistes ou si cela a été réalisé une seule fois — et l'endosymbiote ensuite perdu —, ce qui résoudrait le problème des Straménopiles non photosynthétiques.

La Paramécie est un exemple d'Alvéolé cilié (Alveolata, Ciliophora).
Stentor roeseli (Alveolata, Ciliophora), Alvéolé cilié en forme de trompe.
Plasmodium falciparum (Alveolata, Apicomplexa), parasite responsable du paludisme (stade en anneau dans une hématie).
Cercomonas sp. (Rhizaria, Cercozoa), Cercozoaire flagellé.
Chlorarachnion reptans (Rhizaria, Cercozoa), Chlorarachniophyte.
Colonies de Zoothamnium niveum (Oligohymenophorea) à la Réunion.

Géologie

Le plus ancien fossile connu présumé date du Précambrien (700 Ma).

Liste des embranchements/divisions

Selon AlgaeBase (29 janvier 2022) :

Embranchement des Bacillariophyta Karsten
Embranchement des Bigyra Cavalier-Smith
Embranchement des Cryptophyta Cavalier-Smith
Embranchement des Katablepharidophyta N.Okamoto & I.Inouye
Embranchement des Ochrophyta Cavalier-Smith
Embranchement des Telonemia Shalchian-Tabrizi & al.
Embranchement des Chromista phylum incertae sedis
sous-règne des Hacrobia
- Embranchement des Cryptista Cavalier-Smith
- Embranchement des Haptophyta Hibberd ex Edvardsen & Eikrem
sous-règne des Harosa (supergroupe SAR)
- infra-règne des Halvaria (ou Heterokonta ?)
  - Embranchement des Ciliophora Doflein
  - Embranchement des Miozoa Cavalier-Smith
  - Embranchement des Oomycota Arx
- infra-règne des Rhizaria
  - Embranchement des Foraminiferida d'Orbigny

Selon Cavalier-Smith (1981, 2004, 2010)^[8]^,^[9]^,^[3] :

sous-règne des Harosa (Cavalier-Smith 2010)
- infrarègne des Heterokonta (Cavalier-Smith 1986)
  - embranchement des Bigyra (Cavalier-Smith 1998)
  - embranchement des Pseudofungi (Cavalier-Smith 1986)
  - embranchement des Ochrophyta (Cavalier-Smith 1986)
    - sous-embranchement des Phaeista (Cavalier-Smith 1995)
      - infraembranchement des Hypogyrista (Cavalier-Smith 1995)
      - infraembranchement des Chrysista (es) (Cavalier-Smith 1986)
    - sous-embranchement des Diatomeae (Dumortier 1821)
- infrarègne des Alveolata (Cavalier-Smith 1991)
  - embranchement des Myzozoa (Cavalier-Smith 2004)
    - sous-embranchement des Dinozoa (Cavalier-Smith 1981)
    - sous-embranchement des Apicomplexa (Levine 1970)
  - embranchement des Ciliophora (Doflein 1901)
- infrarègne des Rhizaria (Cavalier-Smith 2002)
  - embranchement des Cercozoa (Cavalier-Smith 1998)
  - embranchement des Retaria (Cavalier-Smith 1999)
    - sous-embranchement des Foraminifera (Eichwald 1830)
    - sous-embranchement des Radiozoa (Cavalier-Smith 1987)
sous-règne des Hacrobia (Okamoto et al. 2009)
- embranchement des Cryptista (Cavalier-Smith 1989)
- embranchement des Haptophyta (Hibberd 1976)
- embranchement des Heliozoa (Haeckel 1862)

Selon ITIS (13 mars 2012)^[10] :

division des Bacillariophyta

Selon Catalogue of Life (13 mars 2012)^[11] :

embranchement des Cryptophyta
embranchement des Haptophyta
embranchement des Hyphochytriomycota
embranchement des Labyrinthista
embranchement des Ochrophyta
embranchement des Oomycota
embranchement des Sagenista (en)
embranchement des Chromista phylum incertae sedis

Selon World Register of Marine Species (13 mars 2012)^[12] :

sous-règne Hacrobia
- embranchement des Cryptophyta
- embranchement des Haptophyta
- embranchement des Heliozoa
sous-règne des Harosa
- infra-règne des Alveolata
  - embranchement des Ciliophora
  - embranchement des Myzozoa
- infra-règne des Heterokonta
  - embranchement des Bigyra
  - embranchement des Ochrophyta
  - embranchement des Oomycota
- infra-règne des Rhizaria
  - embranchement des Cercozoa
  - embranchement des Foraminifera
  - embranchement des Radiozoa

Selon Aubert (2017)^[13] :

imperium Eukaryota
- regnum Chromista
  - subregnum Hacrobia
    - phylum Haptista (en)
    - phylum Cryptista
  - subregnum Harosa
    - infraregnum Rhizaria
      - phylum Cercozoa
      - phylum Retaria
    - infraregnum Halvaria
      - superphylum Alveolata
        phylum Myzozoa
        
        phylum Ciliophora
      - superphylum Heterokonta
        phylum Bigyra
        
        phylum Pseudofungi
        
        phylum Ochrophyta

Voir aussi

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

Catégorie Chromista, sur Wikimedia Commons
Chromista, sur Wikispecies

(en) Référence AlgaeBase : règne Chromista (+classification) (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence BioLib : Chromista Cavalier-Smith, 1981 (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence Catalogue of Life : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(fr + en) Référence GBIF : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence IRMNG : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(fr + en) Référence ITIS : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence OEPP : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence Paleobiology Database : Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence Taxonomicon : Chromista Caval.-Sm. (1981) (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence UICN : taxon Chromista (consulté le 25 septembre 2023)
(en) Référence WoRMS : Chromista (+ liste embranchements + liste classes) (consulté le 25 septembre 2023)
Chromista (Univ Paris Sud 11)

Notes et références

Notes

↑ Dans leur ouvrage Classification phylogénétique du vivant, Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader désignent les Chromistes sous le nom de « lignée brune ».

Références

↑ (en) Cavalier-Smith, T. (1981). Eukaryote kingdoms: seven or nine?. Biosystems 14: 461-481
↑ Burki et al., 2007, Phylogenomics Reshuffles the Eukaryotic Supergroups.
↑ ^{a et b} (en) Cavalier-Smith T, « Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree », Biol. Lett., vol. 6, n^o 3,‎ juin 2010, p. 342–5 (PMID 20031978, DOI 10.1098/rsbl.2009.0948, lire en ligne)
↑ Augier M (1965). Biochimie et taxinomie chez les Algues. Bulletin de la Société Botanique de France, 112(sup1), 8-15.
↑ Thomas Cavalier-Smith, M. T. Allsopp et E. E. Chao, « Chimeric conundra: are nucleomorphs and chromists monophyletic or polyphyletic? », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 91, n^o 24,‎ novembre 1994, p. 11368–11372 (PMID 7972066, PMCID 45232, DOI 10.1073/pnas.91.24.11368 , Bibcode 1994PNAS...9111368C)
↑ Fabien Burki, Andrew J. Roger, Matthew W. Brown et Alastair G.B. Simpson, « The New Tree of Eukaryotes », Elsevier, vol. 35, n^o 1,‎ 2020, p. 43–55 (ISSN 0169-5347, PMID 31606140, DOI 10.1016/j.tree.2019.08.008, S2CID 204545629)
↑ Jürgen F. H. Strassert, Iker Irisarri, Tom A. Williams et Fabien Burki, « A molecular timescale for eukaryote evolution with implications for the origin of red algal-derived plastids », Nature Communications, vol. 12, n^o 1,‎ 25 mars 2021, p. 1879 (ISSN 2041-1723, PMID 33767194, PMCID 7994803, DOI 10.1038/s41467-021-22044-z)
↑ Thomas Cavalier-Smith, "Eukaryotic kingdoms: seven or nine?", BioSystems, Vol.14, No.3-4, 1981, p.461–481. DOI 10.1016/0303-2647(81)90050-2
↑ Thomas Cavalier-Smith, "Only six kingdoms of life", Proceedings of the Royal Society B, Vol.271, No.1545, June 22, 2004, p.1251–1262. DOI 10.1098/rspb.2004.2705
↑ Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 13 mars 2012
↑ Catalogue of Life Checklist, consulté le 13 mars 2012
↑ World Register of Marine Species, consulté le 13 mars 2012
↑ Damien Aubert, Classer le vivant : Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne, Paris, Ellipses, 2017, 496 p. [détail de l’édition] (ISBN 978-2-340-01773-3), chap. V (« La classification synthétique »), p. 324.