Enterobacteriaceae

Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.

Vous pouvez partager vos connaissances en l’améliorant (comment ?) selon les recommandations des projets correspondants.

Enterobacteriaceae

E. coli ici observée au microscope électronique est l'une des Entérobactéries les plus connues

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Embranchement	Pseudomonadota
Classe	Gammaproteobacteria
Ordre	Enterobacterales

Famille

Enterobacteriaceae
Rahn 1937

Les Enterobacteriaceae sont une famille de bacilles Gram négatifs de l'ordre des Enterobacterales. Leur nom provient de Enterobacter qui est l'un des genres, mais exceptionnellement pas le genre type, de cette famille : le genre type des Enterobacteriaceae est Escherichia. C'est de loin la plus grande famille de l'ordre auquel elle appartient.

« Entérobactéries » est un terme imprécis sur le plan taxonomique mais largement utilisé pour désigner des bactéries abondantes dans le tube digestif des Mammifères et dans l'environnement, dotées de certaines caractéristiques biologiques communes. Avant l'ère de la phylogénétique moléculaire, lorsque les familles bactériennes n'étaient définies que par des critères phénotypiques, il pouvait désigner la famille des Enterobacteriaceae. Depuis la refonte de l'ordre des Enterobacterales réalisée en 2016 par Adeolu et al. sur des critères génomiques^[1], le périmètre des Enterobacteriaceae a été réduit et ces deux termes ne sont plus synonymes.

Liste de genres

Genres validement publiés

Selon la LPSN (24 octobre 2022)^[2] :

Buttiauxella Ferragut et al. 1982
Cedecea Grimont et al. 1981
Citrobacter Werkman & Gillen 1932
Cronobacter Iversen et al. 2008
Enterobacillus Patil et al. 2015
Enterobacter Hormaeche & Edwards 1960
Escherichia Castellani & Chalmers 1919 – genre type
Franconibacter Stephan et al. 2014
Gibbsiella Brady et al. 2011
Huaxiibacter He et al. 2022
Intestinirhabdus Xu et al. 2020
Izhakiella Aizenberg-Gershtein et al. 2016
Klebsiella Trevisan 1885
Kluyvera Farmer et al. 1981
Kosakonia Brady et al. 2013
Leclercia Tamura et al. 1987
Lelliottia Brady et al. 2013
Limnobaculum Baek et al. 2019
Mangrovibacter Rameshkumar et al. 2010
Phytobacter Zhang et al. 2017
Plesiomonas corrig. Habs & Schubert 1962
Pluralibacter Brady et al. 2013
Pseudescherichia Alnajar & Gupta 2017
Pseudocitrobacter Kämpfer et al. 2014
Raoultella Drancourt et al. 2001
Rosenbergiella Halpern et al. 2013
Saccharobacter Yaping et al. 1990
Salmonella Lignieres 1900
Scandinavium Marathe et al. 2020
Shigella Castellani & Chalmers 1919
Shimwellia Priest & Barker 2010
Siccibacter Stephan et al. 2014
Symbiopectobacterium Nadal-Jimenez et al. 2022
Tenebrionibacter Hu & Yang 2022
Tenebrionicola Lee et al. 2022
Trabulsiella McWhorter et al. 1992
Yokenella Kosako et al. 1985

Genres reclassés (synonymes)

Selon la LPSN (6 novembre 2022)^[3] les genres suivants ont été reclassés au sein de la famille des Enterobacteriaceae :

Calymmatobacterium Aragão & Vianna 1913 : reclassé en Klebsiella
Koserella Hickman-Brenner et al. 1985 : reclassé en Yokenella
Levinea Young et al. 1971 : reclassé en Citrobacter
Metakosakonia Alnajar & Gupta 2017 : reclassé en Phytobacter

De plus, le genre Entomohabitans Lee et al. 2022 (fam. Enterobacteriaceae) a été reclassé en Erwinia (fam. Erwiniaceae).

Genres en attente de publication valide

Selon la LPSN (6 novembre 2022)^[3] (Ca. signifie Candidatus) :

« Aranicola » Schabereiter-Gurtner et al. 2001
« Atlantibacter » Hata et al. 2016
« Averyella » Johnson et al. 2005
« Ca. Blochmaniella » corrig. Sauer et al. 2000
« Cloaca » Castellani & Chalmers 1919
« Colobactrum » Borman et al. 1944
« Ca. Cuticulibacterium » corrig. Wier et al. 2004
« Edaphovirga » Xue et al. 2019
« Encapsulatus » Castellani & Chalmers 1919
« Erythrobacillus » Fortineau 1905
« Galloisinimonas » Park et al. 2012
« Jejubacter » Jiang et al. 2020
« Ca. Macropleicola » Kölsch et al. 2009
« Ca. Moranella » McCutcheon & von Dohlen 2011
« Nissabacter » Mlaga et al. 2017
« Padlewskia » Macierewicz 1966
« Paracolobactrum » Borman et al. 1944
« Ca. Phloeobacter » corrig. Zreik et al. 1998
« Ca. Profftia » Toenshoff et al. 2012
« Proshigella » Borman et al. 1944
« Pseudenterobacter » Wu et al. 2020
« Ca. Regiella » Moran et al. 2005
« Ca. Riesia » Sasaki-Fukatsu et al. 2006
« Ca. Stammerella » corrig. Mazzon et al. 2008
« Superficieibacter » Potter et al. 2018
« Ca. Trabutinella » Szabó et al. 2017
« Ca. Westeberhardia » Klein et al. 2016
« Ca. Williamhamiltonella » corrig. Moran et al. 2005

Notes et références

↑ Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575–5599. Accès libre.
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 24 octobre 2022
↑ ^{a et b} List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 6 novembre 2022

Voir aussi

Références taxonomiques

(en) Référence BioLib : Enterobacteriaceae Rahn, 1937
(en) Référence Catalogue of Life : Enterobacteriaceae Rahn, 1937 (consulté le 26 novembre 2021)
(fr + en) Référence ITIS : Enterobacteriaceae Rahn, 1937
(en) Référence NCBI : Enterobacteriaceae Rahn, 1937 (taxons inclus)
(en) Référence WoRMS : Enterobacteriaceae (+ liste genres + liste espèces)