VIL1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1UNC, 3FG7 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VIL1, D2S1471, VIL, villin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 193040 MGI: 98930 HomoloGene: 5169 GeneCards: VIL1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • lysophosphatidic acid binding • calcium ion binding • protein homodimerization activity • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • actin binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • Філоподія • ruffle • клітинна мембрана • нуклеоплазма • Мікроворсинки • filopodium tip • brush border • actin filament bundle • екзосома • цитоскелет • lamellipodium |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • actin nucleation • positive regulation of lamellipodium morphogenesis • cytoplasmic actin-based contraction involved in cell motility • epithelial cell differentiation • epidermal growth factor receptor signaling pathway • response to bacterium • positive regulation of cell migration • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • actin filament depolymerization • actin filament severing • barbed-end actin filament capping • positive regulation of epithelial cell migration • regulation of lamellipodium morphogenesis • terminal web assembly • cellular response to epidermal growth factor stimulus • actin filament polymerization • regulation of wound healing • cytoskeleton organization • actin filament capping • regulation of cell shape • positive regulation of multicellular organism growth • intestinal D-glucose absorption • positive regulation of actin filament bundle assembly • regulation of microvillus length • regulation of actin nucleation • positive regulation of actin filament depolymerization • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of protein localization to plasma membrane • GO:0034622 protein-containing complex assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 218.42 – 218.45 Mb | Хр. 1: 74.45 – 74.47 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VIL1 (англ. Villin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 827 амінокислот, а молекулярна маса — 92 695[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTKLSAQVKG | | SLNITTPGLQ | | IWRIEAMQMV | | PVPSSTFGSF | | FDGDCYIILA |
IHKTASSLSY | | DIHYWIGQDS | | SLDEQGAAAI | | YTTQMDDFLK | | GRAVQHREVQ |
GNESEAFRGY | | FKQGLVIRKG | | GVASGMKHVE | | TNSYDVQRLL | | HVKGKRNVVA |
GEVEMSWKSF | | NRGDVFLLDL | | GKLIIQWNGP | | ESTRMERLRG | | MTLAKEIRDQ |
ERGGRTYVGV | | VDGENELASP | | KLMEVMNHVL | | GKRRELKAAV | | PDTVVEPALK |
AALKLYHVSD | | SEGNLVVREV | | ATRPLTQDLL | | SHEDCYILDQ | | GGLKIYVWKG |
KKANEQEKKG | | AMSHALNFIK | | AKQYPPSTQV | | EVQNDGAESA | | VFQQLFQKWT |
ASNRTSGLGK | | THTVGSVAKV | | EQVKFDATSM | | HVKPQVAAQQ | | KMVDDGSGEV |
QVWRIENLEL | | VPVDSKWLGH | | FYGGDCYLLL | | YTYLIGEKQH | | YLLYVWQGSQ |
ASQDEITASA | | YQAVILDQKY | | NGEPVQIRVP | | MGKEPPHLMS | | IFKGRMVVYQ |
GGTSRTNNLE | | TGPSTRLFQV | | QGTGANNTKA | | FEVPARANFL | | NSNDVFVLKT |
QSCCYLWCGK | | GCSGDEREMA | | KMVADTISRT | | EKQVVVEGQE | | PANFWMALGG |
KAPYANTKRL | | QEENLVITPR | | LFECSNKTGR | | FLATEIPDFN | | QDDLEEDDVF |
LLDVWDQVFF | | WIGKHANEEE | | KKAAATTAQE | | YLKTHPSGRD | | PETPIIVVKQ |
GHEPPTFTGW | | FLAWDPFKWS | | NTKSYEDLKA | | ELGNSRDWSQ | | ITAEVTSPKV |
DVFNANSNLS | | SGPLPIFPLE | | QLVNKPVEEL | | PEGVDPSRKE | | EHLSIEDFTQ |
AFGMTPAAFS | | ALPRWKQQNL | | KKEKGLF |
Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhai L., Zhao P., Panebra A., Guerrerio A.L., Khurana S. (2001). Tyrosine phosphorylation of villin regulates the organization of the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 276: 36163—36167. PMID 11500485 DOI:10.1074/jbc.C100418200
- Kumar N., Zhao P., Tomar A., Galea C.A., Khurana S. (2004). Association of villin with phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate regulates the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 279: 3096—3110. PMID 14594952 DOI:10.1074/jbc.M308878200
- Kumar N., Khurana S. (2004). Identification of a functional switch for actin severing by cytoskeletal proteins. J. Biol. Chem. 279: 24915—24918. PMID 15084600 DOI:10.1074/jbc.C400110200
- Kumar N., Tomar A., Parrill A.L., Khurana S. (2004). Functional dissection and molecular characterization of calcium-sensitive actin-capping and actin-depolymerizing sites in villin. J. Biol. Chem. 279: 45036—45046. PMID 15272027 DOI:10.1074/jbc.M405424200
- Tomar A., George S., Kansal P., Wang Y., Khurana S. (2006). Interaction of phospholipase C-gamma1 with villin regulates epithelial cell migration. J. Biol. Chem. 281: 31972—31986. PMID 16921170 DOI:10.1074/jbc.M604323200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12690 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P09327 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |