EF-G

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EC編號 3.6.5.3
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Translation elongation factor EFG/EF2
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標誌Transl_elong_EFG/EF2
InterPro英语InterProIPR004540
SCOP英语Structural Classification of Proteins1n0u / SUPFAM
EFG/EF2, domain IV
鑑定
標誌EFG_IV
PfamPF03764(旧版)
Pfam宗系CL0329(旧版)
SMART英语Simple Modular Architecture Research ToolSM00889
CDD英语Conserved Domain Databasecd01434
現有可用的蛋白結構:
Pfam結構(旧版) / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum英语PDBsum結構概要

延伸因子G(Elongation Factor G),簡稱EF-G,又稱EF-2,曾被稱爲轉位酶(translocase),是一種原核延伸因子,具有GTP酶活性。現認爲EF-G的GTP酶活性與tRNA和mRNA穿過核糖體的協同移動有關[1]

功能

EF-G在每一輪多肽鏈延長的結束階段催化tRNA和mRNA的轉位到核糖體的下游[1]。和EF-Tu*tRNA*GTP三元複合物相似,EF-G與核糖體結合時處於與GTP結合的狀態。

除了在翻译中的作用外,EF-G还与核糖体再循环因子英语Ribosome Recycling Factor一起以GTP依赖方式促进核糖体再循环[2]

临床应用

一般来说,EF-G的功能可被夫西地酸抑制,但已检出某些细菌对夫西地酸的抗药性[3][4]

進化

EF-G的進化歷程複雜,細菌有很多EF-G的旁系變體,說明不同的EF-G變體可能發生了亚功能化英语subfunctionalization[5]

參考

  1. ^ 1.0 1.1 Shoji, S; Walker, SE; Fredrick, K. Ribosomal translocation: one step closer to the molecular mechanism. ACS Chem Biol. 2009, 4: 93–107. PMID 19173642. doi:10.1021/cb8002946. 
  2. ^ Zavialov AV, Hauryliuk VV, Ehrenberg M. Splitting of the posttermination ribosome into subunits by the concerted action of RRF and EF-G. Molecular Cell. 2005, 18 (6): 675–686. PMID 15949442. doi:10.1016/j.molcel.2005.05.016. 
  3. ^ Macvanin M, Hughes D. Hyper-susceptibility of a fusidic acid-resistant mutant of Salmonella to different classes of antibiotics. FEMS microbiology letters. June 2005, 247 (2): 215–20 [2014-02-03]. PMID 15935566. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.007. (原始内容存档于2018-04-10). 
  4. ^ Macvanin M, Johanson U, Ehrenberg M, Hughes D. Fusidic acid-resistant EF-G perturbs the accumulation of ppGpp. Molecular Microbiology. July 2000, 37 (1): 98–107. PMID 10931308. doi:10.1046/j.1365-2958.2000.01967.x. [永久失效連結]
  5. ^ G C Atkinson; S L Baldauf. Evolution of elongation factor G and the origins of mitochondrial and chloroplast forms. Molecular Biology and Evolution. 2011, 28 (3): 1281–92. PMID 21097998. doi:10.1093/molbev/msq316. 

外部連結

蛋白质生物合成:翻译(原核翻译 · 古菌翻译 · 真核翻译
基本概念
核糖体蛋白质

PIF1 · PIF2 · PIF3

古菌起始因子

aIF1 · aIF2 · aIF5 · aIF6

真核起始因子
43S
起始前複合物
eIF1(AX · AY · 1B)

eIF2(S1 · S2 · S3) · B1 · B2 · B3 · B4 · B5 · eIF2激酶

eIF3(A · B · C · D · F · G · H · I · J · K · M · S6)

eIF4(eIF4A(A1 · A2 · A3) · B · E1 · E2 · G1 · G2 · G3 · H)

eIF5(A · A2 · B)

eIF6

EF-Tu · EF-Ts · EF-G

古菌延伸因子

aEF1 · aEF2

eEF1(A1 · A2 · A3 · B1 · B2 · B3 · B4 · D · E1 · G) · eEF2

原核释放因子 · 古菌释放因子 · 真核释放因子英语Eukaryotic release factors

其他

RPS1 · RPS2 · RPS3 · RPS4 · RPS5 · RPS6 · RPS7 · RPS8 · RPS9 · RPS10 · RPS11 · RPS12 · RPS13 · RPS14 · RPS15 · RPS16 · RPS17 · RPS18 · RPS19 · RPS20 · RPS21 · RPS22 · RPS23 · RPS24 · RPS25 · RPS26 · RPS27 · RPS28 · RPS29

遗传学索引
描述
  • 生化
  • 基因表达
  • DNA
    • 复制
    • 周期蛋白
    • 基因重组
    • 修复
  • 转录
    • 转录因子与细胞内受体
    • 辅调节因子
    • RNA
    • 重复序列
    • 转录后修饰
  • 翻译
    • 核糖体亚基
    • 翻译后修饰
    • 分拣蛋白英语Template:Sorting nexin
  • DNA结合蛋白英语Template:DNA-binding proteins/RNA结合蛋白英语Template:RNA-binding proteins
    • 核糖核蛋白)
  • 蛋白质
    • 结构域
    • 结构
      • 2+°
疾病
  • Replication and repair英语Template:DNA replication and repair-deficiency disorder
  • Transcription factor英语Template:Transcription factor and coregulator deficiencies
  • 转录相关疾病英语Template:Disorders of transcription and post transcriptional modification
  • 轉譯相關疾病
3.6.1
  • 焦磷酸酶
  • 三磷酸腺苷双磷酸酶英语Apyrase
  • 硫胺素三磷酸酶英语Thiamine-triphosphatase
3.6.2
  • 腺嘌呤硫酸酯酶英语Adenylylsulfatase
  • 磷酸腺嘌呤酰基硫酸酯酶英语Phosphoadenylylsulfatase
3.6.3-4: ATP酶
3.6.3
Cu²⁺ (3.6.3.4)
  • Menkes/ATP7A
  • Wilson/ATP7B
Ca²⁺ (3.6.3.8)
  • SERCA
    • ATP2A1
    • ATP2A2
    • ATP2A3
  • 质膜
    • ATP2B1
    • ATP2B2
    • ATP2B3
    • ATP2B4
  • SPCA
    • ATP2C1
    • ATP2C2
Na+/K+ (3.6.3.9)
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP1B4
H+/K+ (3.6.3.10)
  • ATP4A
P型ATP酶
  • ATP8B1
  • ATP10A
  • ATP11B
  • ATP12A
  • ATP13A2
  • ATP13A3
3.6.4
3.6.5: GTP酶英语GTPase
3.6.5.1: 异三聚体G蛋白英语Heterotrimeric G protein
  • Gαs
  • Gαi
    • GNAI1
    • GNAI2
    • GNAI3
  • Gαq/11
    • GNAQ
    • GNA11
  • Gα12/13
    • GNA12
    • GNA13
  • Transducin
    • GNAT1
    • GNAT2
3.6.5.2: 小G蛋白 > Ras超家族
  • Rho family of GTPases: Cdc42
    • CDC42
    • TC10
    • TCL
  • RhoUV
    • RhoU
    • RhoV
  • Rac
    • Rac1
    • 2
    • 3
    • RhoG
  • RhoBTB
    • 1
    • 2
  • RhoH
  • Rho
    • A
    • B
    • C
  • Rnd
    • 1
    • 2
    • 3
  • RhoDF
    • RhoF
    • RhoD
  • other: Ras
    • HRAS
    • KRAS
    • NRAS
  • Rab
    • RAB23
    • RAB27
  • Arf
    • ARF6
    • SAR1B
    • ARL13B
    • ARL6
  • Ran
  • Rheb
  • Rap
3.6.5.3: 蛋白质合成GTP酶
3.6.5.5-6: 聚合马达
EC 1.1/2/3/4/5/6/7/8/9/10/11/12/13/14/15/16/17/18/19/20/21/22 · 2.1/2/3/4/5/6/7(2.7.10/11-12)/8/9 · 3.1/2/3/4(3.4.21/22/23/24)/5/6/7/8/9/10/11/12/13 · 4.1/2/3/4/5/6 · 5.1/2/3/4/5/99 · 6.1-3英语Template:Ligases CO CS and CN/4/5-6