MSR1

MSR1
Идентификаторы
ПсевдонимыMSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Внешние IDOMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1
Расположение гена (человек)
8-я хромосома человека
Хр.8-я хромосома человека[1]
8-я хромосома человека
Расположение в геноме MSR1
Расположение в геноме MSR1
Локус8p22Начало16,107,878 bp[1]
Конец16,567,490 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
8-я хромосома мыши
Хр.8-я хромосома мыши[2]
8-я хромосома мыши
Расположение в геноме MSR1
Расположение в геноме MSR1
Локус8 A4|8 23.89 cMНачало40,034,726 bp[2]
Конец40,095,714 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung

  • visceral pleura
Наибольшая экспрессия в
  • seminiferous tubule

  • left lobe of liver

  • body of femur
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • scavenger receptor activity
  • связывание с белками плазмы
  • low-density lipoprotein particle binding
  • amyloid-beta binding
  • cargo receptor activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • endocytic vesicle membrane
  • цитозоль
  • клеточная мембрана
  • Коллаген
  • часть клеточной мембраны
  • мембрана
  • low-density lipoprotein particle
  • цитоплазматическая везикула
Биологический процесс
  • cholesterol transport
  • plasma lipoprotein particle clearance
  • cellular response to organic cyclic compound
  • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation
  • эндоцитоз
  • рецепторно-опосредованный эндоцитоз
  • lipoprotein transport
  • positive regulation of cholesterol storage
  • phagocytosis, engulfment
  • negative regulation of gene expression
  • amyloid-beta clearance
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

4481

20288

Ensembl

ENSG00000038945

ENSMUSG00000025044

UniProt

P21757

P30204

RefSeq (мРНК)

NM_138716
NM_002445
NM_138715
NM_001363744

NM_001113326
NM_031195

RefSeq (белок)

NP_002436
NP_619729
NP_619730
NP_001350673

NP_001106797
NP_112472

Локус (UCSC)Chr 8: 16.11 – 16.57 MbChr 8: 40.03 – 40.1 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1; CD204) — мембранный белок, скавенджер-рецептор макрофагов, продукт гена MSR1[5][6].

Функции

Белок MSR1 относится к классу A макрофагальных скавенджер-рецепторов. В результате альтернативного сплайсинга образуются три изоформы. Все три изоформы являются тримерными мембранными гликопротеинами, которые играют роль во многих физиологических и патологических процессах, связанных с макрофагами, включая атеросклероз, болезнь Альцгеймера и иммунную реакцию. Ранее считалось, что рецептор экспрессирован только на макрофагах, но позже был обнаружен также на некоторых типах дентритных клетках[7].

Изоформы 1 и 2 являются функциональными рецепторами, которые опосредуют эндоцитоз липопротеинов низкой плотности. Изоформа 3 не приводит к интернализации липопротеинов низкой плотности. В результате изменённого внутриклеточного процессинга эта изоформа остаётся в эндоплазматическом ретикулюме, однако она может ингибировать функционирование активных форм белка за счёт доминантно-негативного эффекта, поэтому предполагается, что изоформа 3 участвует в регуляции скавенджер-рецептора в макрофагах[5].

Литература

  • Asaoka H., Matsumoto A., Itakura H., Kodama T. [Structural and function of the human macrophage scavenger receptor] (англ.) // Nippon Rinsho : journal. — 1993. — Vol. 51, no. 6. — P. 1677—1683. — PMID 8391600.
  • Naito M., Suzuki H., Mori T., etal. Coexpression of type I and type II human macrophage scavenger receptors in macrophages of various organs and foam cells in atherosclerotic lesions (англ.) // Am. J. Pathol.[англ.] : journal. — 1992. — Vol. 141, no. 3. — P. 591—599. — PMID 1519666. — PMC 1886699.
  • Matsumoto A., Naito M., Itakura H., etal. Human macrophage scavenger receptors: primary structure, expression, and localization in atherosclerotic lesions (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1991. — Vol. 87, no. 23. — P. 9133—9137. — doi:10.1073/pnas.87.23.9133. — Bibcode: 1990PNAS...87.9133M. — PMID 2251254. — PMC 55118.
  • Emi M., Asaoka H., Matsumoto A., etal. Structure, organization, and chromosomal mapping of the human macrophage scavenger receptor gene (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1993. — Vol. 268, no. 3. — P. 2120—2125. — PMID 8093617.
  • Ashkenas J., Penman M., Vasile E., etal. Structures and high and low affinity ligand binding properties of murine type I and type II macrophage scavenger receptors (англ.) // J. Lipid Res.[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 34, no. 6. — P. 983—1000. — PMID 8394868.
  • Resnick D., Chatterton J. E., Schwartz K., etal. Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 43. — P. 26924—26930. — doi:10.1074/jbc.271.43.26924. — PMID 8900177.
  • Hsu H. Y., Hajjar D. P., Khan K. M., Falcone D. J. Ligand binding to macrophage scavenger receptor-A induces urokinase-type plasminogen activator expression by a protein kinase-dependent signaling pathway (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 2. — P. 1240—1246. — doi:10.1074/jbc.273.2.1240. — PMID 9422792.
  • Gough P. J., Greaves D. R., Gordon S. A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake (англ.) // J. Lipid Res.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 39, no. 3. — P. 531—543. — PMID 9548586.
  • Teupser D., Thiery J., Seidel D. Alpha-tocopherol down-regulates scavenger receptor activity in macrophages (англ.) // Atherosclerosis : journal. — 1999. — Vol. 144, no. 1. — P. 109—115. — doi:10.1016/S0021-9150(99)00040-4. — PMID 10381284.
  • Nakamura T., Hinagata J., Tanaka T., etal. HSP90, HSP70, and GAPDH directly interact with the cytoplasmic domain of macrophage scavenger receptors (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 290, no. 2. — P. 858—864. — doi:10.1006/bbrc.2001.6271. — PMID 11785981.
  • Tomokiyo R., Jinnouchi K., Honda M., etal. Production, characterization, and interspecies reactivities of monoclonal antibodies against human class A macrophage scavenger receptors (англ.) // Atherosclerosis : journal. — 2002. — Vol. 161, no. 1. — P. 123—132. — doi:10.1016/S0021-9150(01)00624-4. — PMID 11882324.
  • Xu J., Zheng S. L., Komiya A., etal. Germline mutations and sequence variants of the macrophage scavenger receptor 1 gene are associated with prostate cancer risk (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2002. — Vol. 32, no. 2. — P. 321—325. — doi:10.1038/ng994. — PMID 12244320.
  • Xu J., Zheng S. L., Komiya A., etal. Common sequence variants of the macrophage scavenger receptor 1 gene are associated with prostate cancer risk (англ.) // Am. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 72, no. 1. — P. 208—212. — doi:10.1086/345802. — PMID 12471593. — PMC 378627.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — Bibcode: 2002PNAS...9916899M. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Kosswig N., Rice S., Daugherty A., Post S. R. Class A scavenger receptor-mediated adhesion and internalization require distinct cytoplasmic domains (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 36. — P. 34219—34225. — doi:10.1074/jbc.M303465200. — PMID 12819208.
  • Miller D. C., Zheng S. L., Dunn R. L., etal. Germ-line mutations of the macrophage scavenger receptor 1 gene: association with prostate cancer risk in African-American men (англ.) // Cancer Research[англ.] : journal. — American Association for Cancer Research[англ.], 2003. — Vol. 63, no. 13. — P. 3486—3489. — PMID 12839931.
  • Wang L., McDonnell S. K., Cunningham J. M., etal. No association of germline alteration of MSR1 with prostate cancer risk (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2003. — Vol. 35, no. 2. — P. 128—129. — doi:10.1038/ng1239. — PMID 12958598.
  • Nupponen N. N., Wallén M. J., Ponciano D., etal. Mutational analysis of susceptibility genes RNASEL/HPC1, ELAC2/HPC2, and MSR1 in sporadic prostate cancer (англ.) // Genes Chromosomes Cancer[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 39, no. 2. — P. 119—125. — doi:10.1002/gcc.10308. — PMID 14695991.
  • Hillman R. T., Green R. E., Brenner S. E. An unappreciated role for RNA surveillance (англ.) // Genome Biol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 5, no. 2. — P. R8. — doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8. — PMID 14759258. — PMC 395752.


Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000038945 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025044 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 Entrez Gene: MSR1 macrophage scavenger receptor 1  (неопр.).
  6. ↑ Matsumoto A., Naito M., Itakura H., Ikemoto S., Asaoka H., Hayakawa I., Kanamori H., Aburatani H., Takaku F., Suzuki H. Human macrophage scavenger receptors: primary structure, expression, and localization in atherosclerotic lesions (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — December (vol. 87, no. 23). — P. 9133—9137. — doi:10.1073/pnas.87.23.9133. — Bibcode: 1990PNAS...87.9133M. — PMID 2251254. — PMC 55118.
  7. ↑ Herber D. L., Cao W., Nefedova Y., Novitskiy S. V., Nagaraj S., Tyurin V. A., Corzo A., Cho H. I., Celis E., Lennox B., Knight S. C., Padhya T., McCaffrey T. V., McCaffrey J. C., Antonia S., Fishman M., Ferris R. L., Kagan V. E., Gabrilovich D. I. Lipid accumulation and dendritic cell dysfunction in cancer (англ.) // Nat. Med. : journal. — 2010. — August (vol. 16, no. 8). — P. 880—886. — doi:10.1038/nm.2172. — PMID 20622859. — PMC 2917488.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400