Integraza
 | |||||||||
| Struktura n-terminalnog zn vezujućeg domena hiv-1 integraze (e forme), nmr, 38 struktura | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | Integrase_Zn | ||||||||
| Pfam | PF02022 | ||||||||
| InterPro | IPR003308 | ||||||||
| SCOP | 1wjb | ||||||||
| Superfamilija | 1wjb | ||||||||
| |||||||||
 | |||||||||
| Kristalna struktura rsv, dvodomenske integraze | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | rve | ||||||||
| Pfam | PF00665 | ||||||||
| Pfam klan | CL0219 | ||||||||
| InterPro | IPR001584 | ||||||||
| SCOP | 2itg | ||||||||
| Superfamilija | 2itg | ||||||||
| |||||||||
| | |||||||||
| kristalna struktura rsv dvodomenske integraze | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Simbol | IN_DBD_C | ||||||||
| Pfam | PF00552 | ||||||||
| InterPro | IPR001037 | ||||||||
| SCOP | 1ihw | ||||||||
| Superfamilija | 1ihw | ||||||||
| |||||||||
Retrovirusna integraze (IN) enzim je koji proizvode retrovirusi (poput HIVa), koji omogućavaju da se njihov genetički materijal integriše u DNK inficirane ćelije. Retrovirusni IN enzimi se razlikuju od fagnih integraza, poput λ fagne integraze (Int).
IN je ključna komponenta retrovirusnog preintegracionog kompleksa (PIC).
Strukture
Svi retrovirusni IN proteini sadrže tri kanonička domena, povezana fleksibilnim sponama:
- N-terminusni HH-CC zink-vezujući domen (tri-heliksni svežanj je stabilizovan koordinacijom Zn(II) katjona)
- katalotičko sržni domen (RNazaH savijanje)
- C-terminusni DNK-vezujući domen (SH3 motiv)[1]
Kristalne i NMR strukture individualnih domena i 2-domenski konstrakti integraza iz HIV-1, HIV-2, SIV, i Rous Sarcoma Virusa (RSV) su poznati. Prva struktura je određena 1994.
Biohemijski i strukturni podaci sugerišu da retrovirusne integraze deluju kao tetrameri (dimeri dimera). Sva tri domena su važna za multimerizaciju i vezivanje viralne DNK. Tokom ranih 2010, rešene su kristalne strukture IN iz prototipnog PFV virusa sklopljene na viralnim DNK krajevima.[2]
Vidi još
- Rekombinazna tehnologija specifična za mesto
Reference
- ↑ Lodi PJ, Ernst JA, Kuszewski J, Hickman AB, Engelman A, Craigie R, Clore GM, Gronenborn AM (August 1995). „Solution structure of the DNA binding domain of HIV-1 integrase”. Biochemistry 34 (31): 9826–33. DOI:10.1021/bi00031a002. PMID 7632683.
- ↑ „Scientists say crack HIV/AIDS puzzle for drugs”. Reuters. January 31, 2010.
Vanjske veze
- MeSH Integrases
- p
- r
- u
fosfotransferaze/kinaze
(PO4)
2.7.1: OH- akceptor | Hekso- • Gluko- • Frukto- (Hepatička) • Galakto- • Fosfofrukto- (1, Jetra, Mišić, Trombocit, 2) • Riboflavin • Šikimat • Timidin (ADP-timidin) • NAD+ • Glicerol • Pantotenat • Mevalonat • Piruvat • Deoksicitidin • PFP • Diacilglocerol • Fosfoinozitid 3 (Klasa I PI 3, Klasa II PI 3) • Sfingozin • Glukoza-1,6-bisfosfat sintaza |
|---|---|
2.7.2: COOH akceptor | |
2.7.3: N akceptor | |
2.7.4: PO4 akceptor |
(P2O7)
(PO4-nukleozid)
| |||||
Druge |
Fosfatidiltransferaze | |
|---|---|
Glikozil-1-fosfotransferaza |
(PO4; proteinski akceptor)
2.7.10: proteinske-tirozinske | vidi tirozinske kinaze |
|---|---|
2.7.11: proteinske-serin/treonin | vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze |
2.7.12: dualna specifičnost | vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze |
2.7.13: protein-histidinske |
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
