| CLEC4M |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • peptide antigen binding
• virus receptor activity
• зв'язування з іоном металу
• calcium-dependent protein binding
• mannose binding
• virion binding
• ICAM-3 receptor activity
• carbohydrate binding
• signaling receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• integral component of membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• host cell
|
|---|
| Біологічний процес | • leukocyte cell-cell adhesion
• cell-cell recognition
• GO:0046795 intracellular transport of virus
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• antigen processing and presentation
• ендоцитоз
• адаптивна імунна відповідь
• процес імунної системи
• viral genome replication
• peptide antigen transport
• modulation by virus of host process
• вроджений імунітет
• GO:0022415 viral process
• virion attachment to host cell
• viral entry into host cell
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001144904
NM_001144905
NM_001144906
NM_001144907
NM_001144908
| NM_001144909
NM_001144910
NM_001144911
NM_014257
NM_214675
NM_214676 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | NP_001138376
NP_001138377
NP_001138378
NP_001138379
NP_001138380
| NP_001138381
NP_001138382
NP_001138383
NP_055072 |
| |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 7.76 – 7.77 Mb | Хр. 8: 3.79 – 3.8 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 45 350[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MSDSKEPRVQ | | QLGLLEEDPT | | TSGIRLFPRD | | FQFQQIHGHK | | SSTGCLGHGA |
| LVLQLLSFML | | LAGVLVAILV | | QVSKVPSSLS | | QEQSEQDAIY | | QNLTQLKAAV |
| GELSEKSKLQ | | EIYQELTQLK | | AAVGELPEKS | | KLQEIYQELT | | RLKAAVGELP |
| EKSKLQEIYQ | | ELTRLKAAVG | | ELPEKSKLQE | | IYQELTRLKA | | AVGELPEKSK |
| LQEIYQELTE | | LKAAVGELPE | | KSKLQEIYQE | | LTQLKAAVGE | | LPDQSKQQQI |
| YQELTDLKTA | | FERLCRHCPK | | DWTFFQGNCY | | FMSNSQRNWH | | DSVTACQEVR |
| AQLVVIKTAE | | EQNFLQLQTS | | RSNRFSWMGL | | SDLNQEGTWQ | | WVDGSPLSPS |
| FQRYWNSGEP | | NNSGNEDCAE | | FSGSGWNDNR | | CDVDNYWICK | | KPAACFRDE |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. (1999). Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank. Gene. 228: 161—167. PMID 10072769 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00004-9
- Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
- Jeffers S.A., Hemmila E.M., Holmes K.V. (2006). Human coronavirus 229E can use CD209L (L-SIGN) to enter cells. Adv. Exp. Med. Biol. 581: 265—269. PMID 17037540 DOI:10.1007/978-0-387-33012-9_44
- da Silva R.C., Segat L., Crovella S. (2011). Role of DC-SIGN and L-SIGN receptors in HIV-1 vertical transmission. Hum. Immunol. 72: 305—311. PMID 21277928 DOI:10.1016/j.humimm.2011.01.012
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13523 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H2X3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
Білки: кластери диференціації |
|---|
| | 1-50 | |
|---|
| | 51-100 | |
|---|
| | 101-150 | |
|---|
| | 151-200 | |
|---|
| | 201-250 | |
|---|
| | 251-300 | |
|---|
| | 301-350 | |
|---|
|
