ITGAV

ITGAV
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JV2, 1L5G, 1M1X, 1U8C, 3IJE, 4G1E, 4G1M, 4MMX, 4MMY, 4MMZ, 4O02, 4UM8, 4UM9

Ідентифікатори
Символи ITGAV, CD51, MSK8, VNRA, VTNR, integrin subunit alpha V
Зовнішні ІД OMIM: 193210 MGI: 96608 HomoloGene: 20510 GeneCards: ITGAV
Реагує на сполуку
cilengitide[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transforming growth factor beta binding
• зв'язування з іоном металу
• voltage-gated calcium channel activity
• virus receptor activity
• protein kinase C binding
• protease binding
• extracellular matrix protein binding
• extracellular matrix binding
• fibronectin binding
• opsonin binding
• insulin-like growth factor I binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• fibroblast growth factor binding
• neuregulin binding
• coreceptor activity
• C-X3-C chemokine binding
• signaling receptor binding
• пептидний зв'язок
• integrin binding

Клітинна компонента

• lamellipodium membrane
• integrin alphav-beta3 complex
• екзосома
• alphav-beta3 integrin-IGF-1-IGF1R complex
• integral component of membrane
• integrin alphav-beta5 complex
• мембрана
• integrin alphav-beta8 complex
• ruffle membrane
• integrin complex
• microvillus membrane
• filopodium membrane
• external side of plasma membrane
• phagocytic vesicle
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• cell surface
• гіалоплазма
• focal adhesion
• міжклітинні контакти
• specific granule membrane
• integrin alphav-beta6 complex
• alphav-beta3 integrin-PKCalpha complex
• alphav-beta3 integrin-HMGB1 complex

Біологічний процес

• regulation of phagocytosis
• apoptotic cell clearance
• endodermal cell differentiation
• apolipoprotein A-I-mediated signaling pathway
• negative chemotaxis
• negative regulation of lipid storage
• extracellular matrix organization
• heterotypic cell-cell adhesion
• positive regulation of cell migration
• regulation of apoptotic cell clearance
• substrate adhesion-dependent cell spreading
• vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
• cell-matrix adhesion
• GO:0022415 viral process
• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent
• blood vessel development
• negative regulation of entry of bacterium into host cell
• integrin-mediated signaling pathway
• calcium ion transmembrane transport
• negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation
• negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway
• leukocyte migration
• cell-substrate adhesion
• negative regulation of lipoprotein metabolic process
• negative regulation of lipid transport
• extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
• positive regulation of cell adhesion
• ERK1 and ERK2 cascade
• cell growth
• positive regulation of osteoblast proliferation
• адгезія клітин
• Ангіогенез
• васкулогенез
• cellular calcium ion homeostasis
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• positive regulation of cell population proliferation
• cell migration
• neutrophil degranulation
• positive regulation of MAPK cascade
• cell adhesion mediated by integrin
• viral entry into host cell
• regulation of transforming growth factor beta activation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3685
16410
Ensembl
ENSG00000138448
ENSMUSG00000027087
UniProt
P06756
P43406
RefSeq (мРНК)
NM_001144999
NM_001145000
NM_002210
NM_008402
NM_001398691
RefSeq (білок)
NP_001138471
NP_001138472
NP_002201
NP_032428
NP_001385620
Локус (UCSC) Хр. 2: 186.59 – 186.68 Mb Хр. 2: 83.55 – 83.64 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGAV (англ. Integrin subunit alpha V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 116 038[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFG
FAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSSTRRCQPI
EFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRTEMKQ
EREPVGTCFLQDGTKTVEYAPCRSQDIDADGQGFCQGGFSIDFTKADRVL
LGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDS
YLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIYDGKNMSSLYNFTGE
QMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQ
RASGDFQTTKLNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKK
GIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYP
DLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKV
SCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPS
HSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRLDYRTAAD
TTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVSVDSDQKKIYIG
DDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAF
KTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSS
NLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEE
DVGPVVQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNTLLYILHYDIDGPM
NCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIH
TLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSL
KSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGIQPAPMPVPVWVIILA
VLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKRVRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Donahue J.P., Sugg N., Hawiger J. (1994). The integrin alpha v gene: identification and characterization of the promoter region. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 228—232. PMID 7522056 DOI:10.1016/0167-4781(94)90278-X
  • Cheresh D.A., Smith J.W., Cooper H.M., Quaranta V. (1989). A novel vitronectin receptor integrin (alpha v beta x) is responsible for distinct adhesive properties of carcinoma cells. Cell. 57: 59—69. PMID 2467745 DOI:10.1016/0092-8674(89)90172-4
  • Joki-Korpela P., Marjomaki V., Krogerus C., Heino J., Hyypia T. (2001). Entry of human parechovirus 1. J. Virol. 75: 1958—1967. PMID 11160695 DOI:10.1128/JVI.75.4.1958-1967.2001
  • Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
  • Vallon M., Essler M. (2006). Proteolytically processed soluble tumor endothelial marker (TEM) 5 mediates endothelial cell survival during angiogenesis by linking integrin alpha(v)beta3 to glycosaminoglycans. J. Biol. Chem. 281: 34179—34188. PMID 16982628 DOI:10.1074/jbc.M605291200

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Integrin alpha-V переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, P06756 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.